Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms