Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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