Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms