Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rpusd2Q149F1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rpusd2Q149F1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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