Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms