Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PctpP53808 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PctpP53808 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PctpP53808 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms