Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms