Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VimP20152 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VimP20152 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VimP20152 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VimP20152 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
VimP20152 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VimP20152 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms