Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf13O54965 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf13O54965 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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