Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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