Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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