Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3550W4VSN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms