Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn7Q9Z261 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms