Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VarsQ9Z1Q9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VarsQ9Z1Q9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms