Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdf15Q9Z0J7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf15Q9Z0J7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.2 ms