Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msl3Q9WVG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msl3Q9WVG9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms