Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn5Q9WVD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms