Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx1Q9WV80 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx1Q9WV80 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx1Q9WV80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms