Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapaQ9WV55 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms