Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scnn1bQ9WU38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scnn1bQ9WU38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms