Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms