Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nfe2l3Q9WTM4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2l3Q9WTM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2l3Q9WTM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms