Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam50bQ9WTJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam50bQ9WTJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam50bQ9WTJ8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms