Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf103Q9R1W3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf103Q9R1W3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf103Q9R1W3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf103Q9R1W3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf103Q9R1W3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf103Q9R1W3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf103Q9R1W3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms