Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms