Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms