Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg1Q9QZE5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms