Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Tspan3Q9QY33 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Tspan3Q9QY33 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Tspan3Q9QY33 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tspan3Q9QY33 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tspan3Q9QY33 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tspan3Q9QY33 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan3Q9QY33 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan3Q9QY33 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Tspan3Q9QY33 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms