Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e3Q9QXZ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms