Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-OaQ9QWV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-OaQ9QWV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-OaQ9QWV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms