Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr5Q9JLF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr5Q9JLF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms