Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ldb3Q9JKS4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb3Q9JKS4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms