Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcan3Q9JKK0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rcan3Q9JKK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms