Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp5Q9JKD3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms