Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rilpl1Q9JJC6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rilpl1Q9JJC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rilpl1Q9JJC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rilpl1Q9JJC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rilpl1Q9JJC6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rilpl1Q9JJC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rilpl1Q9JJC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms