Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc86Q9JJ89 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 592.4 ms