Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb1Q9JIF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms