Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pus3Q9JI38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pus3Q9JI38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms