Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtaQ9JHK4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtaQ9JHK4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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