Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Jph3Q9ET77 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jph3Q9ET77 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms