Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ropn1Q9ESG2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ropn1Q9ESG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ropn1Q9ESG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms