Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc4Q9ES56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms