Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Ndst4Q9EQW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Ndst4Q9EQW8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
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Ndst4Q9EQW8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Ndst4Q9EQW8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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Ndst4Q9EQW8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst4Q9EQW8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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Ndst4Q9EQW8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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Ndst4Q9EQW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Ndst4Q9EQW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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Ndst4Q9EQW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst4Q9EQW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms