Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r63Q9EPT1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r63Q9EPT1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms