Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms