Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtr1Q9DBC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtr1Q9DBC3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtr1Q9DBC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms