Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB96

Ngdn, Neuroguidin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgdnQ9DB96 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NgdnQ9DB96 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NgdnQ9DB96 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NgdnQ9DB96 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms