Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg9Q9DB90 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg9Q9DB90 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms