Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop5Q9DB28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pop5Q9DB28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop5Q9DB28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms