Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc54Q9DAL3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms